西藏林芝地区藏医院为副县级事业建制，人员总编制35人，床位50张，年门诊人次4万余人次，年住院人次380人。 医院始终坚持务实创新的精神，正确处理继承与创新的关系，在医治各种疑难杂症方面，如类风湿性关节炎、慢性肾炎、心脑血管等治疗方法上积累了丰富的临床经验。

该院承担藏医学院和区内其他院校的实习生的培训任务，还承担藏医药管理局举办的基层卫生技术人员专业知识培训班的教学任务3期，共计32人。 地区藏医院制剂中心1994年正式投入生产，制剂中心总建筑面积3379.7平方米，共有21种国药准字号，制剂品种160种，已取得制剂准字号73种。

该院坚持"能藏不西，先藏后西，藏西医结合"的原则，确定心脑血管和风湿专科为医院重点专科建设目标，主要目标有运用藏医理论对高血压等病种的机理、临床诊断、治疗、药物，疗效评价进行研究，并形成规范化操作规程以供推广使用。收集和整理、挖掘民间验方、古籍医典和单方，开拓诊疗上的新路子。